宋元稱石弄山，宋乾道《四明圖經(jīng)》卷七：“石弄山，在縣東北九百五十里，山石玲瓏，東西相懸，人可出入�！彼螌殤c《四明志》卷二十：“石弄山，在東北；山石玲瓏，故以名�！泵魅f歷《兩浙海防類考續(xù)編》卷一載為“花腦山”，清代改稱花鳥。

現(xiàn)當(dāng)?shù)孛癖娙远嗨追Q花腦。

清康熙二十七年（1688）屬定�？h蓬萊鄉(xiāng)。

二十九年（1690）劃歸江蘇省崇明縣。

1934年與東、西綠華島合置花洛鄉(xiāng)。

1950年11月析置花鳥鄉(xiāng)。

以主島花鳥山島得名。

1956年3月與洛華鄉(xiāng)復(fù)置花洛鄉(xiāng)。

是年9月復(fù)析為花鳥鄉(xiāng)。

1958年為嵊泗人民公社花鳥生產(chǎn)大隊(duì)。

1962年建花鳥人民公社。

1984年復(fù)為鄉(xiāng)。