村頭古代屬會稽縣袁孝鄉(xiāng),清末屬六社鄉(xiāng),民國后期屬賀社鄉(xiāng)。
解放后,初稱紹興縣馬山區(qū)皇甫鄉(xiāng)與村,合作社時稱孫端鄉(xiāng)村頭高級農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社,馬山(區(qū))人民公社時稱村頭生產(chǎn)大隊(duì),1961年歸屬皇甫人民公社,1962年大隊(duì)一分為二,稱皇甫公社新建大隊(duì)建國大隊(duì),“文革”時沿之,1980年大隊(duì)改名為村頭東岸、村頭西岸,1983年稱皇甫鄉(xiāng)村頭東岸村、村頭西岸村。
1992年起歸屬孫端鎮(zhèn),2003年兩村合并組建成村頭村至今。