明嘉靖年間屬來暮鄉(xiāng)三十七都和三十八都；1931年分屬甲岙、許峰、曹川、許協(xié)鄉(xiāng)；1935年分屬甲峰、曹許鄉(xiāng)，屬第二區(qū)；1946年改稱曹村鄉(xiāng)；1949年又分為曹許、甲峰兩鄉(xiāng)，改屬馬嶼區(qū)；1950年3月為曹村鄉(xiāng)；1956年2月設(shè)立曹村（大）鄉(xiāng)；1958年9月稱曹村生產(chǎn)大隊(duì)（1959年改稱管理區(qū)），屬馬嶼公社；1961年改建為曹村人民公社；1984年復(fù)置曹村鄉(xiāng)；1987年9月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)；2011年并入馬嶼鎮(zhèn)；2015年12月復(fù)置曹村鎮(zhèn)，沿用至今。