1949年稱車坑、黃皮、橋陌農(nóng)民協(xié)會(行政村),1956年稱車坑、黃皮、橋陌農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社,1958年稱車坑、黃皮、橋陌生產(chǎn)隊,1961年稱車坑、黃皮、橋陌大隊,1962年車坑大隊析建桐梓大隊,1984年稱車根、黃皮、橋陌、桐梓行政村,分設村民委員會,屬車根鄉(xiāng)。
1992年撤區(qū)擴鎮(zhèn)并鄉(xiāng),車根、齋郎兩鄉(xiāng)合置稱百山祖鄉(xiāng),改屬百山祖鄉(xiāng),村名復稱車坑行政村。
2013年百山祖鄉(xiāng)、合湖鄉(xiāng)合并設立百山祖鎮(zhèn),屬百山祖鎮(zhèn)。
2019年5月,車坑村、黃皮村、橋陌村、桐梓村合并建立百山祖村。
村委會駐地車根。