現(xiàn)村域在南宋淳熙十二年(1185)屬壽昌鄉(xiāng);宋末推行都圖制后屬十都;清雍正六年(1728)屬商家莊;民國(guó)三十年(1941)屬石屏鄉(xiāng)。
解放初為石屏鄉(xiāng)第一、第二、第三村,1950年劃建小鄉(xiāng)后分屬石屏鄉(xiāng)、南山鄉(xiāng)。
1983年12月政社分設(shè)后,分別組建商家、下官山、寺墈頭、毛家等4個(gè)村的村民委員會(huì),屬石屏鄉(xiāng)人民政府領(lǐng)導(dǎo),2005年4月起屬航頭鎮(zhèn)政府領(lǐng)導(dǎo),2007年7月四村合并,取名靈棲村,組建村民委員會(huì)開(kāi)展基層自治管理和服務(wù)。