明清時期屬敷教鄉(xiāng)石塘里廿九都垂字莊。

民國廿九年（1940）為敷教鄉(xiāng)1、2、3保，三十六年(1947)為1、2保，1950年為溪口區(qū)閣底鄉(xiāng)1、2、3村，1956年與陳家墩、下閣、苗山頭合建新建高級社，1959年稱閣底、苗山頭生產(chǎn)隊，屬閣底管理區(qū)，1961年析置上閣、下閣、苗山頭、大塘塢大隊，屬閣底公社，1983年改稱上閣、下閣、苗山頭村委會，屬閣底鄉(xiāng)，2005年11月3日行政區(qū)調(diào)整，經(jīng)省人民政府批準(zhǔn)閣底鄉(xiāng)并入青石鎮(zhèn)，稱青石鎮(zhèn)上閣、下閣、苗山頭村，2013年村規(guī)模調(diào)整上閣、下閣、苗山頭3村合并更名為閣底村。