本村為托克遜縣唯一的哈薩克族牧民聚居地。

1943年在托克遜縣北界卡塔汗山北坡放牧的迪化（現(xiàn)烏魯木齊）牧民三蓋巴依，米西尕林登等9戶哈薩克牧民因越界放牧引起草場(chǎng)糾紛，省政府派專人來(lái)處理，由于這9戶牧民持有通溝地方的土地證，便將這9戶牧民劃歸托克遜縣。

后從烏魯木齊托里牧場(chǎng)及阿勒泰遷來(lái)5戶。

1956年通溝村改為牧業(yè)鄉(xiāng)。

1958年為河?xùn)|公社牧業(yè)大隊(duì)。

1977年，通溝大隊(duì)與先鋒公社牧場(chǎng)合并，為先鋒公社通溝大隊(duì)。

1984年建庫(kù)加依鎮(zhèn)時(shí)，命名為通溝村村民委員會(huì)。