解放前為盤龍鄉(xiāng)5保。
解放后1952年民主建政為群樂鄉(xiāng)6村,1958年為紅日公社16管理區(qū),1961年編為群樂公社10大隊(duì),1983年公社改鄉(xiāng)為群樂鄉(xiāng)新店子村。
1992年9月撤銷群樂鄉(xiāng),新店子村劃歸巨龍鎮(zhèn)管轄,為巨龍鎮(zhèn)二十四村。
1994年7月撤群樂鄉(xiāng)復(fù)建群樂鄉(xiāng),為群樂鄉(xiāng)新店子村。
2019年,行政區(qū)劃調(diào)整,將新店子村劃歸巨龍鎮(zhèn)管轄。
2020年,村級(jí)建制調(diào)整,撤銷書房埡村、新店子村,合并設(shè)立新店子村(蓬安府發(fā)〔2020〕6號(hào))。