解放初屬漁箭鄉(xiāng)加強村。

1958年屬漁箭公社四管區(qū)。

1961年為漁箭公社四大隊。

1981年地名普查時改為漁箭公社石廟子大隊。

1984年改為石廟子村。

1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)擴建鎮(zhèn)時劃歸石碾鎮(zhèn)管轄。

1997年成立漁箭管理區(qū)委員會，隸屬漁箭管理區(qū)委員會。

1999年元月后隸屬漁箭鎮(zhèn)。

2019年12月鄉(xiāng)鎮(zhèn)行政區(qū)劃調(diào)整改革時漁箭鎮(zhèn)并入石碾鎮(zhèn)，隸屬石碾鎮(zhèn)，2020年5月村級建制調(diào)整改革時黑水凼村和石廟子村合并為石廟子村，隸屬石碾鎮(zhèn)。