1958年8月,我國全面開展人民公社化運動;同年9月,設立碧石生產大隊管理委員會,簡稱碧石管委會,又稱三大隊。
1968年9月,更名為碧石大隊革命委員會。
1981年6月,復名碧石生產大隊管理委員會。
1984年4月,我國實行政社分設,撤銷碧石生產大隊管理委員會,設立碧石村村民委員會,簡稱碧石村村委會。
1993年以前歸達縣地區(qū)巴中縣管轄,1993年7月5日,設立巴中地區(qū),巴中撤縣建市,屬巴中市恩陽鎮(zhèn)管轄。
2000年6月14日,設巴州區(qū),屬巴中市巴州區(qū)恩陽鎮(zhèn)管轄,2013年1月18日,設恩陽區(qū),屬巴中市恩陽區(qū)恩陽鎮(zhèn)管轄,2014年12月18日,區(qū)劃調整,由原恩陽鎮(zhèn)劃歸登科街道管轄。
2019年,行政區(qū)劃調整,劃歸司城街道管轄。
2020年村級建制調整,將永芳村、碧石村合并,設碧石村。