1949年屬四區(qū)（姚家莊）下轄的一個(gè)自然村；1953年屬四區(qū)（姚家莊））下轄的一個(gè)自然村；1954年屬直屬鄉(xiāng)下轄的自然村；1956年屬魏家窯鄉(xiāng)下轄的一個(gè)自然村；1958年屬城南鄉(xiāng)下轄的一一個(gè)自然村；1959年屬城關(guān)人民公社下轄的一個(gè)自然村；1961年屬曹村人民公社下轄的一個(gè)生產(chǎn)大隊(duì)；1984年屬曹村鄉(xiāng)下轄的村民委員會(huì)；2001年曹村鄉(xiāng)并入城關(guān)鎮(zhèn)，同時(shí)改名為豐州鎮(zhèn)；南垴村民委員會(huì)屬于豐州鎮(zhèn)管轄至今。

2019年合并行政村，將白家窯村并入南垴村。