清代屬榆林縣鎮(zhèn)城和保寧堡口外地域。

1949年6月前，屬河西鄉(xiāng)。

1949年6月后，隸屬榆林縣河西區(qū)，曾設(shè)可可蓋、補(bǔ)兔寨鄉(xiāng)。

1950年，設(shè)馬合區(qū)、八區(qū)、十一區(qū)。

1958年9月，撤區(qū)改設(shè)馬合公社。

1960年1月，并入馬合農(nóng)場(chǎng)。

1969年1月，復(fù)設(shè)馬合公社。

1984年7月，改設(shè)為鄉(xiāng)。

同年9月，劃出可可蓋、昌汗峁、腦冒海則等7個(gè)行政村，設(shè)可可蓋鄉(xiāng)。

1997年11月，改設(shè)馬合鎮(zhèn)。

2002年5月，可可蓋鄉(xiāng)腦冒海則村并入。