春秋時(shí)期屬卞邑。
西漢初期屬桓宣縣。
三國時(shí)期屬南武陽縣。
南北朝時(shí)屬武陽縣。
唐貞觀元年(627年)屬費(fèi)縣。
1945年10月,屬蒙山縣。
1952年3月,蒙山縣撤銷,其第一至第四區(qū)及所轄73個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)劃入平邑縣,設(shè)九區(qū)仲村鎮(zhèn)。
1953年10月24日,九區(qū)仲村鎮(zhèn)劃設(shè)為區(qū)轄鎮(zhèn)。
1955年11月,九區(qū)改為仲村區(qū)。
1958年3月,撤區(qū)并鄉(xiāng),為仲村鄉(xiāng),同年冬,撤銷鄉(xiāng)鎮(zhèn)建制,全縣建立“政社合一”的人民公社,仲村鄉(xiāng)更名為紅風(fēng)人民公社。
1959年3月,改為仲村人民公社。
1961年5月,撤社設(shè)區(qū),區(qū)下設(shè)公社,以駐地命名。
仲村人民公社更名為仲村區(qū)。
1971年4月,復(fù)稱仲村人民公社。
1984年4月我國實(shí)行“政社分開”,改為仲村區(qū)。
1985年8月,仲村區(qū)析建為仲村鎮(zhèn)和李家莊鄉(xiāng)。
2000年12月,岐山鎮(zhèn)并入仲村鎮(zhèn)。