宋代時期，境域?qū)倥钊R縣沙門寨地。

元、明時，屬蓬萊縣牽牛社。

清道光年間，長山諸島劃為13社，境域為砣磯島社；清宣統(tǒng)時，社內(nèi)轄大口、后口、磨石嘴、井口、呂山口5村。

民國十七年（1928年），為長山八島民政局所轄，仍名駝磯社。

民國二十三年（1934年），社改鄉(xiāng)。

民國三十四年（1945年），設(shè)砣磯區(qū)，屬長山島特區(qū)。

民國三十六年（1947年），改設(shè)駝磯鄉(xiāng)。

1949年后，仍為砣磯鄉(xiāng)。

1958年11月，長島縣并入蓬萊縣，為長島公社砣磯大隊。

1963年6月，復(fù)置長島縣，改設(shè)駝磯公社。

1984年，撤公社設(shè)砣磯鎮(zhèn)。

2000年12月，撤鎮(zhèn)改設(shè)砣磯區(qū)公所。

2003年2月，改設(shè)砣磯鎮(zhèn)。