1942年9月，西川辦事處成立，馬蹄溝歸西川辦事處管轄；1958年實行公社化，設(shè)“馬蹄溝人民公社”，隸屬子洲縣人民委員會管轄；1961年建三眼泉公社，1984年分別改馬蹄溝鎮(zhèn)、三眼泉鄉(xiāng)。

2001年，撤鄉(xiāng)三眼泉鄉(xiāng)，并入馬蹄溝鎮(zhèn)。

2011年，撤鄉(xiāng)瓜園則灣鄉(xiāng)，并入馬蹄溝鎮(zhèn)，歸子洲縣人民政府管轄。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名馬蹄溝生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷馬蹄溝生產(chǎn)大隊，設(shè)立馬蹄溝村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名四旗里生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷四旗里生產(chǎn)大隊，設(shè)立四旗里村民委員會，沿用至今。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名清水溝生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷清水溝生產(chǎn)大隊，設(shè)立清水溝村村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名張家砭生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷張家砭生產(chǎn)大隊，設(shè)立張家砭村民委員會，沿用至今。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名水澆灣生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷水澆灣生產(chǎn)大隊，設(shè)立水澆灣村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名張圪臺生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷張圪臺生產(chǎn)大隊，設(shè)立張圪臺村村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名三皇峁生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷三皇峁生產(chǎn)大隊，設(shè)立三皇峁村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以村委會駐地名稱命名為瓦窯峁生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷瓦窯峁生產(chǎn)大隊，設(shè)立瓦窯峁村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以村委會駐地名稱命名為薛家崖生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷薛家崖生產(chǎn)大隊，設(shè)立薛家崖村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名袁家砭生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷袁家砭生產(chǎn)大隊，設(shè)立袁家砭村村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以村委會駐地命名為栗家溝生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷栗家溝生產(chǎn)大隊，設(shè)立栗家溝村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名李家砭產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷李家砭生產(chǎn)大隊，設(shè)立李家砭村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名后曹峁產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷后曹峁生產(chǎn)大隊，設(shè)立后曹峁村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名吉利坪生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷吉利坪生產(chǎn)大隊，設(shè)立吉利坪村民委員會。

1958年8月，實行公社化，以駐地名稱命名梁家溝生產(chǎn)大隊；1983年10月，中共中央，國務院聯(lián)合發(fā)出《關(guān)于實行行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)、建設(shè)人民政府，同時，生產(chǎn)大隊更名為村，撤銷生產(chǎn)大隊管理委員會，選舉產(chǎn)生村民委員會，1984年，撤銷梁家溝生產(chǎn)大隊，設(shè)立梁家溝村村民委員會。