明嘉靖十三年(1534年)為東北隅、西北隅轄15街1巷。

清乾隆二十七年(1762年)為東北隅、西隅，轄5圖。

1935年)屬龍溪縣第一區(qū)，1939年屬文元區(qū)，1947年為崇安鎮(zhèn)。

1949年11月屬城關(guān)一區(qū)，1951年屬漳州市一區(qū)。

1955年2月15日，建置東鋪頭辦事處，作為漳州市人民政府的派出機(jī)構(gòu)。

1960年5月改稱東鋪頭街道人民公社，1963年7月復(fù)稱東鋪頭街道辦事處，1968年11月成立東鋪頭街道人民公社革命委員會，1980年7月恢復(fù)東鋪頭街道辦事處，1985年7月市改區(qū)，為薌城區(qū)人民政府派出機(jī)構(gòu)。

解放前此地城是龍溪縣城關(guān)鎮(zhèn)的一部分，解放后屬龍溪縣城關(guān)一區(qū)，1955年2月15日建西橋街道辦事處，1960年改稱西橋人民公社，1963年復(fù)稱西橋街道辦事處，1968年10月成立西橋人民公社革命委員會，1980年7月恢復(fù)原名，1985年市改區(qū)后，為薌城區(qū)人民政府派出機(jī)構(gòu)。

1955年2月15日建置新橋街道辦事處，1960年改稱新橋街道人民公社，1963年復(fù)稱新橋街道辦事處，1968年10月成立新橋人民公社革命委員會，1980年7月1日恢復(fù)原建制，1985年7月漳州市建制升為地級市，原縣級漳州市改為薌城區(qū)，新橋街道從此隸屬薌城區(qū)。

1955年2月建置巷口街道辦事處。

1960年改稱巷口街道人民公社。

1963年7月復(fù)稱巷口街道辦事處。

1968年10月成立巷口人民公社革命委員會。

1980年7月恢復(fù)巷口街道辦事處。

1985年7月市改區(qū)后，為區(qū)人民政府派出機(jī)構(gòu)。

1999年6月，薌城區(qū)對鎮(zhèn)（街）行政區(qū)域進(jìn)行重新規(guī)劃，從芝山鎮(zhèn)劃市尾村、塔后村、群勇村和前鋒村部分農(nóng)轉(zhuǎn)非居民歸巷口街道管轄。

南坑街道組建于1982年7月8日金省人民政府批準(zhǔn)，1983年2月7日正式設(shè)立南坑街道辦事處，1985年7月漳州市建制升為地級市，原漳州市改為薌城區(qū)，南坑街道從此隸屬薌城區(qū)。

1998年8月18日經(jīng)上級批準(zhǔn)設(shè)立薌城區(qū)通北街道，一直沿用至今。

芝山鎮(zhèn)在明、清時期分屬漳州城；1949年11月部分分屬漳州城關(guān)一區(qū)、城關(guān)二區(qū)和第五區(qū)；1952年部分分屬縣級漳州市和龍溪縣六區(qū)、十區(qū)；1958年8月成立城郊公社。

1984年10月設(shè)芝山鄉(xiāng)人民政府；1985年7月縣級漳州市改稱薌城區(qū)，芝山為區(qū)轄鄉(xiāng)；1992年改制為芝山鎮(zhèn)；2021年5月撤鎮(zhèn)設(shè)街道。

明清時期屬龍溪縣二十六都；1935年屬龍溪縣第五區(qū)；解放后1956年3月屬龍溪縣石亭區(qū)的石亭鄉(xiāng)，北斗鄉(xiāng)；1958年9月屬龍溪縣星火公社；1961年6月由龍溪縣劃歸漳州市，建立石亭、北斗兩個公社；1980年8月石亭、北斗合并為石亭公社，1984年10月撤消公社為石亭鄉(xiāng)人民政府；1985年7月市改區(qū)，石亭為區(qū)轄鄉(xiāng)；1992年4月改制為石亭鎮(zhèn)；2021年5月24日經(jīng)福建省人民政府批準(zhǔn)撤銷石亭鎮(zhèn)，設(shè)立石亭街道。

浦南歷史悠久，早在原始社會就有人類活動。

唐總章二年(669)陳政率府兵平蠻嘯亂，就是從浦南香州(今溪園村)渡江，進(jìn)軍龍溪縣。

唐景龍二年(708)在浦南創(chuàng)辦松洲書院，系全國最早的講學(xué)書院。

清代駐有綠營旗，設(shè)檢查站，稱浦南汛。

明、清時期分屬龍溪縣二十三四都。

1935年屬龍溪縣第五區(qū)(浦南區(qū))的南洲鎮(zhèn)(轄8保)、滄浦鄉(xiāng)(轄8保)；1947年屬龍溪縣浦南鄉(xiāng)，轄13保。

1949年9月，屬龍溪縣第五區(qū);1950年11月，屬龍溪縣第八區(qū)(浦南區(qū));1956年3月，屬龍溪縣石亭區(qū)的浯滄鄉(xiāng)、鰲浦鄉(xiāng)、宏道鄉(xiāng)、浦南鎮(zhèn);1958年9月，屬龍溪縣星火公社;1959年3月，屬浦南公社;1960年8月浦南公社屬龍�？h，1961年6月，由龍海縣劃歸縣級漳州市，析為浦南、浦林2個公社;1980年8月，浦南、浦林合并為浦南公社;1984年10月，撤銷公社設(shè)浦南鎮(zhèn)人民政府。

1985年7月，縣級漳州市改稱薌城區(qū)，浦南為區(qū)轄鎮(zhèn)。

1954年置天寶鄉(xiāng)，1960年改天寶人民公社，1984年天寶人民公社管理委員會改為天寶鎮(zhèn)人民政府。