解放前，瓦窩鎮(zhèn)隸屬復縣管轄，縣城駐地復州城。

王家村公所，駐地王家站。

民國三十五年（1946年）2月，新金縣成立。

民國三十六年（1947年）5月，瓦窩地區(qū)劃歸新金縣四平區(qū)管轄，設11個行政村。

1956年4月，村建制取消，成立瓦窩鄉(xiāng)，歸新金縣蓮山區(qū)管轄。

1958年10月，撤鄉(xiāng)建制，屬四平公社。

1961年9月，從四平公社劃出成立瓦窩公社。

1983年9月，瓦窩人民公社管理委員會改稱瓦窩鄉(xiāng)人民政府。

1984年4月，瓦窩鄉(xiāng)改瓦窩鎮(zhèn)。

2013年1月8日，根據(jù)《遼寧省人民政府關(guān)于調(diào)整大連市部分行政區(qū)劃的批復》(遼政發(fā)〔2012〕169號)要求，將原隸屬于普蘭店市的瓦窩鎮(zhèn)劃歸至瓦房店市管轄。