1949年前為贛縣贛州鎮(zhèn)25、26保及白云鄉(xiāng)部分轄域；1949年11月1日分屬第五區(qū)第1、2村政委員會及贛縣白云鄉(xiāng)；1950年5月23日屬贛州市白云鄉(xiāng)，1952年4月屬市郊區(qū)南外鄉(xiāng)、西外鄉(xiāng)；1953年8月1日屬第三區(qū)南外鄉(xiāng)、西外鄉(xiāng)；1956年6月15日屬白云鄉(xiāng)，1958年10月7日屬章貢鄉(xiāng)，1959年10月22日屬南外街道辦事處；1964年8月屬白云公社，1972年年11月11日屬水南公社；1984年4月29日改名為水南鄉(xiāng)紅旗村。

1998年8月5日，將南外街道辦事處分設(shè)為東外、南外街道辦事處，紅旗村委會劃分到南外成立至今。