1949年前名贛縣直屬區(qū)水西鄉(xiāng)第11保;1949年后名贛縣水西區(qū)水西鄉(xiāng)善邊村;1950年屬湖邊區(qū)梨園鄉(xiāng);1958年9月屬紅旗公社湖邊管理區(qū)梨園工區(qū);1959年10月名善邊大隊(duì),屬湖邊公社;1961年4月從贛縣劃屬贛州市,名八0三公社善邊大隊(duì);同年11月復(fù)歸贛縣,名湖邊區(qū)湖邊公社善邊大隊(duì);1965年撤區(qū),屬湖邊公社;1968年11月與劉家坊大隊(duì)并入崗邊大隊(duì);1972年10月分出,復(fù)名湖邊公社善邊大隊(duì);1978年元月隨公社再從贛縣劃屬贛州市;1984年4月公社改鄉(xiāng)后,名湖邊鄉(xiāng)善邊村。
1999年,撤地建市后,劃歸章貢區(qū)湖邊鄉(xiāng)。
2009年3月17日成立贛州市經(jīng)開區(qū)后,委托經(jīng)開區(qū)管理至今。