六合垸地域，上古屬古云夢澤，后因河水沖積形成小片陸地，于是人們便在此挽垸集居、耕作、逐漸形成多個自然村落。

清朝，分屬江陵縣東鄉(xiāng)龍灣汛和東南鄉(xiāng)郝穴汛。

民國初年，分屬龍灣保衛(wèi)總團(tuán)張金河團(tuán)防分局、沙市保衛(wèi)總團(tuán)三湖鄉(xiāng)團(tuán)防分局及郝穴保衛(wèi)總團(tuán)熊家河團(tuán)防分局。

1930年1月至1932年9月，屬中國共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)的江陵縣蘇維埃政府第四區(qū)（張金）和第六區(qū)（赤湖）。

民國21年（1932年）9月，屬江陵縣第三區(qū)（岑河）三湖鄉(xiāng)聯(lián)保及第四區(qū)（龍灣）張金河聯(lián)保、第五區(qū)（郝穴）胡家場聯(lián)保。

民國35年（1946年），廢區(qū)制改設(shè)鄉(xiāng)，屬龍南鄉(xiāng)。

新中國建立初，分屬江陵縣第八區(qū)（張金，后改為十二區(qū)）和第三區(qū)（岑河，后改為第八區(qū)）。

1954年，分屬江陵縣第七區(qū)（郝穴）赤湖鄉(xiāng)、楊中鄉(xiāng)、和潛江縣張金區(qū)新建鄉(xiāng)。

1958年，分屬江陵縣熊河人民公社和荊州專區(qū)水產(chǎn)養(yǎng)殖場南河養(yǎng)殖分場。

1960年7月，中共江陵縣委將王市、鄧港兩個農(nóng)場合并組建六合垸農(nóng)場，下轄4個分場23個生產(chǎn)隊、1個農(nóng)科所及7個公司中。

1960年7月，江陵縣將位于六合垸區(qū)域的王市農(nóng)場、鄧港農(nóng)場合并為六合垸農(nóng)場。

1961年3月，江陵縣委改六合垸農(nóng)場為熊河區(qū)六合公社，隸屬熊河區(qū)。

1961年10月重建六合垸農(nóng)場，屬江陵縣管轄。

1963年白湖農(nóng)場并入六合垸農(nóng)場，隸屬湖北省農(nóng)墾廳。

2002年六合垸農(nóng)場交由屬地管理，更名為荊州市六合垸管理區(qū)（保留農(nóng)場行政建制），2004年9月，荊州市六合垸管理區(qū)更名為江陵縣六合垸管理區(qū)（仍保留農(nóng)場行政建制）至今。