晚清時期屬泉水灣團獅子崖聯保，聯保署社上達河；民國十五年（1926）設四區(qū)，區(qū)署門古寺；民國二十年（1931）賀龍率紅三軍轉戰(zhàn)房縣，開辟蘇區(qū)，建立門古區(qū)蘇維埃政府，轄秦口、石嶺、巨峪三個蘇維埃政府；1932年紅軍撤離房縣，舊政權復辟，設六區(qū)，區(qū)署設門古寺，轄上谷（上達河）、萬佛鄉(xiāng)（門古寺）、巨寶鄉(xiāng)（下壩）、太湖鄉(xiāng)（范家埡）、平湖鄉(xiāng)（太平河）、雙九鄉(xiāng)（九道梁）；民國二十五年（1936）四區(qū)署轉至范家埡，轄門古寺鄉(xiāng)；1949年1月，房縣解放建立新政權，8月設立門古區(qū)；1952年8月改稱十二區(qū)，轄門古寺、黃柏、大柳等20個鄉(xiāng)（1952年8月7日，全縣劃為一個鎮(zhèn)，14個區(qū)，276個鄉(xiāng)，門古為十二區(qū)轄20個）；1956年3月復稱門古區(qū)，轄5鄉(xiāng)（1956年3月，全縣由150個鄉(xiāng)鎮(zhèn)合并為96個大鄉(xiāng)一個集鎮(zhèn)，設門古區(qū)，建設農業(yè)生產合作社，轄5個鄉(xiāng)新華、金榮、光輝、新建、先鋒）；1958年11月根據中共中央關于建立農村人民公社的決定撤銷門古區(qū)成立門古公，轄6個管理區(qū)（1958年11月11日，根據中共中央關于建立農村人民公社的決定，將原來的區(qū)、鄉(xiāng)、高級農業(yè)合作社并成人民公社，管理區(qū)和生產大隊。

全縣為13個人民公社，99個管理區(qū)，702個生產大，3419個生產小隊。

門古區(qū)改為門古人民公社，轄6個管理區(qū)新華、金榮、光輝、新建、先鋒、巨峪）；1961年6月恢復門古區(qū)，轄6個人民公社；1974年3月18日，門古區(qū)獅子巖公社和葉家河、宋家溝、半仄店大隊合并葉家河大隊；1975年3月，撤區(qū)并社，稱門古公社，轄35個生產大隊（1975年撤區(qū)并社：仙家坪、大坪、門古、獅子巖4個公社合并為門古公社。

東河、秦口、巨峪、高塘4個公社合并為巨峪公社）；1976年2月18日，“巨峪公社杉林場”、月日灣大隊“轉為“巨峪公社月日灣黑木耳場由公社直接領導。

12月22日建立大埡國營林場，將門古公社的大埡山大隊、葉家河大隊歸房縣共產主義勞動大學，劃歸大埡山國營林場；1984年6月設區(qū)建鄉(xiāng)稱門古區(qū)，轄9個鄉(xiāng)（1984年6月，設區(qū)建鄉(xiāng)，門古公社與巨峪公社合并為門古區(qū)，轄門古寺鎮(zhèn)、秦口鎮(zhèn)、獅子巖鄉(xiāng)、仙家坪鄉(xiāng)、太平鄉(xiāng)、鑰匙鄉(xiāng)、巨峪鄉(xiāng)、東河鄉(xiāng)、河心鄉(xiāng)）；1987年10月撤銷區(qū)的體制，。

將原門古區(qū)的巨峪，鑰匙，秦口鎮(zhèn)，中壩區(qū)的高塘河等4個小鄉(xiāng)鎮(zhèn)劃出，增設秦口鄉(xiāng)，轄高塘，巨峪，秦口，鑰匙四個管理區(qū)，17個村；2001年4月，撤銷秦口鄉(xiāng)，并入門古寺鎮(zhèn)，改為門古寺鎮(zhèn)，轄61個村，279個組；2012年3月，小村并大村，門古寺鎮(zhèn)將原來61個村合并為19個村，279個組，合并為96個組；2016年10月，楊叉山林場，代東河林區(qū)劃歸門古寺鎮(zhèn)管轄。

現門古寺鎮(zhèn)轄25個村民委員會，3.43萬人，轄區(qū)面積522.48平方千米。