南京高宗建炎元年(1127年)金人攻宗朝京城汴梁(今河南開封),朝廷官宦政客及京畿士紳民眾紛紛難逃。
部分來房移居房縣南山,至此開荒種地以求生存。
為祈禱宋朝不滅管束鄉(xiāng)族鄰里,筑高臺、設神壇拜神靈,定期舉行儀式,祭祀上天祖宗。
歷元明清,明初,縣政府在此地設保甲鄉(xiāng)里,查戶籍權化,催租賦徭役;清光緒7年(1881年)為加強統(tǒng)治,改官民相間的保甲鄉(xiāng)里制,為軍民相間的團,聯(lián)保保甲制,屬三海堰團木瓜河聯(lián)保,南壇保;民團20年(1931年)賀龍率紅三軍來房開辟均房蘇區(qū),建立蘇維埃政權,建立南壇鄉(xiāng)蘇維埃政府。
歸杜川區(qū)蘇維埃政府所轄;民國21年舊政權復辟;民團24年12月(1936年)設南壇保,屬兩河口聯(lián)保;1949年8月,設南壇鄉(xiāng),歸橋上區(qū)所轄;1956年劃歸長勝區(qū)紅塔鄉(xiāng)所轄;1958年11月,稱橋上公社運動管理區(qū)南壇高級農(nóng)業(yè)合作社;1961年6月設南壇人民公社;1975年3月,撤區(qū)并社南壇公社并入紅塔公社,即稱南壇大隊;1984年社區(qū)建鄉(xiāng),撤銷南壇生產(chǎn)大隊,成立南壇鄉(xiāng),轄南壇村民委員會,歸紅塔區(qū)所轄;1987年10月撤區(qū)建大鄉(xiāng),設南壇管理區(qū),下轄5個村,隸屬紅塔鄉(xiāng)所轄;2000年,撤南壇管理區(qū),保留南壇村;2002年,小村并大村,將原南壇管理所轄5個村民委員會合并為南壇村民委員會。
2005年改稱南潭村村民委員會。