原屬考城。

清乾隆四十八年（1783）劃歸睢州。

1912年屬睢縣。

1928年劃歸民權縣，屬孫六區(qū)吳屯聯(lián)保。

1948年屬孫六區(qū)，在此設吳屯鄉(xiāng)。

1956年屬王莊寨鄉(xiāng)，稱吳屯高級農業(yè)生產合作社。

1958年屬孫六人民公社，稱吳屯生產大隊。

1961年屬孫六區(qū)。

1963年屬林七區(qū)。

1965年屬孫六公社。

1969年屬王莊寨公社，稱吳屯生產大隊。

1983年屬王莊寨鄉(xiāng)，稱吳屯村民委員會。

2009年屬王莊寨鎮(zhèn)，稱吳屯村民委員會至今。