清乾隆元年（1736），設(shè)立烏蘭諾爾站（今肇源縣新站）至呼蘭城驛路，在額設(shè)6臺中依次排為第一臺，故名“頭臺”。

中華民國時期，郭爾羅斯后旗設(shè)頭臺鄉(xiāng)。

東北淪陷后，初設(shè)頭臺保，后改設(shè)頭臺村。

1945年“九三”抗日戰(zhàn)爭勝利后，1946年設(shè)置頭臺區(qū)，1949年改為第五區(qū)。

1956年3月，設(shè)置頭臺鄉(xiāng)。

同年4月，改隸肇源縣。

1958年9月，改稱頭臺人民公社。

1984年3月，改為頭臺鄉(xiāng)。

1985年5月，改設(shè)頭臺鎮(zhèn)。