雅爾塞屯形成于清初。

境內(nèi)的哈雅、奈門沁、音欽及哈拉屯均形成于清順治六年（1649）。

黑龍江設(shè)治后，隸屬齊齊哈爾副都統(tǒng)管轄。

清末，先后隸屬黑水廳、龍江府管轄。

中華民國時(shí)期，隸屬龍江縣管轄。

東北淪陷后期，隸屬達(dá)胡店村。

1945年“九三”抗日戰(zhàn)爭(zhēng)勝利后，1946年6月，今雅爾塞一帶分隸龍東縣和龍江縣管轄。

1948年3月，撤銷龍東縣后，統(tǒng)由龍江縣管轄。

所屬區(qū)域，于1948年和1954年分兩次由龍江縣劃歸齊齊哈爾市管轄。

1956年5月，并村劃鄉(xiāng)，設(shè)置雅爾塞達(dá)斡爾族鄉(xiāng)。

1958年12月，改稱雅爾塞農(nóng)場(chǎng)。

1966年改為雅爾塞人民公社。

1984年1月，改為雅爾塞鄉(xiāng)。

同年11月，改設(shè)雅爾塞鎮(zhèn)。