清道光年間（1821—1850年）屬貞豐州下江第四甲石屯亭。

民國二十九年（1940年），望謨建縣，石屯聯(lián)保屬第五區(qū)。

民國三十一年（1942年）1月，改為石屯鄉(xiāng)。

民國三十二年（1943年）2月，石屯、董萬2鄉(xiāng)合并為石萬鄉(xiāng)，屬望謨縣播東區(qū)。

1953年，劃歸樂元區(qū)。

1959年1月，樂元區(qū)和城關(guān)區(qū)合并建樂元公社（駐豈賴村），兩月后撤銷，分別組建樂元公社和城關(guān)公社。

石屯鄉(xiāng)改為石屯管理區(qū)。

1961年，撤銷并入平寨管理區(qū)。

同年恢復(fù)石屯公社。

1984年，撤區(qū)設(shè)石屯、林木山、包樹、打巖4小鄉(xiāng)。

1992年，4小鄉(xiāng)合并為石屯鎮(zhèn)。