民國以前，屬思南府安化縣。

1915年，屬于思南縣中區(qū)。

1950年屬沿堯鄉(xiāng)。

1953年屬四區(qū)、六區(qū)、八區(qū)、七區(qū)。

1956年屬塘頭區(qū)。

1958年公社時代，取名漁溪溝大隊，屬塘頭公社管轄。

1961年撤銷以區(qū)為公社的建制，將管理區(qū)改為公社。

1963年漁溪溝大隊屬塘頭區(qū)的沿江公社管轄。

1984年撤大隊設漁溪溝村，屬孫家壩區(qū)的沿江鄉(xiāng)管轄。

1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)”工作，同年10月，將原沿江、雷坪、毛壩、趙家壩、梧桐鄉(xiāng)合并為邵家橋鎮(zhèn)，轄原五個鄉(xiāng)鎮(zhèn)的共29個行政村，漁溪溝村屬邵家橋鎮(zhèn)管轄。

2007年4月，縣人民政府下達《關于撤小村并大村整合的批復》，全縣開展撤小村并大村工作，把全縣561個村合并成168個村，邵家橋鎮(zhèn)將原34個村合并為9個村，其中，漁溪溝、洋蕉溪、江寨、官坡、邵家橋合并為邵家橋村。

2010年11月16日，思南縣人民政府批準調整全縣行政區(qū)劃，邵家橋鎮(zhèn)調整設置為32個行政村，1個社區(qū)，漁溪溝屬邵家橋鎮(zhèn)管轄。