相傳北宋靖康元年（1126），此處已成村落，隨后陸地?cái)U(kuò)展，居民增多，南宋德祐元年（1275）始成睦洲。

清康熙縣志地圖可見睦洲，屬潮居都十九圖。

民國時(shí)期屬第八區(qū)睦洲鄉(xiāng)。

1951年屬第九區(qū)睦洲鄉(xiāng)。

1958年稱睦洲管理區(qū)。

1959年分稱沖尾大隊(duì)、占源里大隊(duì)、江安里大隊(duì)、承恩里大隊(duì)、上凌大隊(duì)。

1961年分為上寧大隊(duì)、承恩大隊(duì)、占元大隊(duì)、江安大隊(duì)、充美大隊(duì)。

1965年合稱睦洲大隊(duì)。

1984年稱睦洲鄉(xiāng)。

1986年稱睦洲村委會(huì)。

1988年改稱睦洲管理區(qū)。

1999年改稱睦洲村委會(huì)，沿用至今。