始建于宋代，舊屬莆田縣，二十四鋪均屬水南境；宋、元時期屬感德鄉(xiāng)；明、清時期屬四區(qū)莆田里；民國社區(qū)屬三區(qū)洙亭保、登美保；新中國成立后為水南鄉(xiāng)，屬三區(qū)、五區(qū)、黃石區(qū)，后成立黃石鄉(xiāng)水南高級社；1958年后成立黃石人民公社水南生產(chǎn)大隊；“文化大革命”期間與澄沄大隊合并為紅巖大隊；1970年后又改為黃石人民公社水南生產(chǎn)大隊；1987年改稱水南村；2002年改為莆田市荔城區(qū)黃石鎮(zhèn)水南村，設(shè)水南村委會。

2014年設(shè)居委會。