1958年成立肥西旭光社侯店大隊(duì)。
1959年為合肥市肥西縣雙塘公社侯店大隊(duì)(雙塘公社原址在瓦屋村雙塘集,地名由東西兩個塘口得來)。
1975年為合肥市肥西縣雙塘公社與復(fù)興公社合并成立南崗公社,稱為南崗公社侯店生產(chǎn)大隊(duì);1983年為合肥市肥西縣撤區(qū)并鄉(xiāng)南崗公社與陳橋公社合并,成立南崗鎮(zhèn)政府,1992年侯店生產(chǎn)大隊(duì)改名為侯店村民委員會;2006年區(qū)劃調(diào)整合肥市肥西縣南崗鎮(zhèn)侯店村民委員會改為合肥市蜀山區(qū)南崗鎮(zhèn)侯店村民委員會。